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En su debut en ella la siguiente temporada, el conjunto vallisoletano realizó una gran campaña, terminando segundo dentro de su grupo y último en la fase final por el ascenso. En el último encuentro que definía el título frente al América, un gol del delantero Pedro Juan Ibargüen y un penal que fue pitado a favor de Nacional en los últimos minutos, hicieron que el América se retirara del terreno de juego antes de terminar el partido, dando como campeón al conjunto Verde. Y terminó la crónica con lo que parece, a posteriori, como profético: «Su técnica, presentación impecable y moral hacen de este conjunto un equipo de mucho porvenir». El 22 de julio de 1976 se confirmó la llegada de Osvaldo Zubeldía, técnico argentino que había obtenido varios títulos con Estudiantes de La Plata. Para el Finalización el cuerpo técnico fue reforzado con Juan José Peláez, Roberto Vasco y Hernán Darío Gómez, quienes acompañaron a Francisco Maturana.
En julio renunció César López Fretes y lo reemplazó José Curtí. En 1977 se dio el arribo del peruano César Cueto. El peruano César Cueto fue el goleador del equipo con 17 goles. El equipo finalizó en el último lugar del grupo. El primer partido entre universidades tuvo lugar el 9 de febrero de 1895 entre la universidad Hamline y la escuela de Agricultura de la Universidad de Minnesota. En el Finalización, quedó en el cuarto lugar con 21 puntos, pero se clasificó a los cuadrangulares semifinales, allí quedó en el segundo lugar con 7 puntos, por lo que clasificó al cuadrangular final, donde le correspondió enfrentar a Deportes Tolima, América y Junior. Al año siguiente Atlético Nacional finalizó en el cuarto puesto del cuadrangular final. En el partido de vuelta ante Deportivo Quito, ganó por 2-1. El último partido de la primera fase, frente a Emelec, en Medellín, ganó 3-1. Millonarios ganó el grupo, con 10 puntos, seguido de Atlético Nacional con 7 y tercero Deportivo Quito con 4 puntos, clasificándose estos tres a octavos de final. En 1989, Nacional comenzó la copa en el grupo 3, acompañado por Millonarios, giannis antetokounmpo camiseta C. S. Emelec y Deportivo Quito. El segundo partido contra Emelec, en Guayaquil terminó también 1-1. El tercer partido del grupo, contra Deportivo Quito en el estadio Atahualpa terminó también 1-1. El 7 de marzo, en Medellín cayó 0-2 ante Millonarios.
Al final quedó primero en el Apertura, seguido de América y Millonarios. Centrobasket, en el que se enfrentan las selecciones nacionales de México, América Central y el Caribe. Según la tradición de los simpatizantes de este club, los colores oficiales del Club Atlético Boca Juniors fueron elegidos en un juego de azar entre los fundadores, en el cual iban a ser elegidos los colores de la bandera de la primera embarcación que ellos vean arribar al puerto de La Boca. Luego de la histórica consagración llegó a la final de la Copa Libertadores tras eliminar a tres de los mejores equipos del continente como Racing Club, -puntero de la liga-, Independiente -campeón vigente de la Copa Sudamericana- y Grêmio de Porto Alegre -campeón vigente de la Copa Libertadores-. En la Copa Libertadores logró quitarle un invicto de local al Cruzeiro E. C. (que llevaba más de un año sin perder), le derrotó 3-2, con goles de Campáz y Londero, en lo que se convirtió en la primera victoria de un equipo colombiano jugando en Brasil.
